生態(tài)保護補償制度是生態(tài)文明制度的重要組成部分。《條例》全面貫徹落實習近平生態(tài)文明思想，堅持綠水青山就是金山銀山的理念，將黨中央、國務院關(guān)于生態(tài)保護補償?shù)囊?guī)定和要求以及行之有效的經(jīng)驗做法，以綜合性、基礎(chǔ)性行政法規(guī)形式予以鞏固和拓展，確立了生態(tài)保護補償基本制度規(guī)則，以充分發(fā)揮法治固根本、穩(wěn)預期、利長遠的作用?！稐l例》共6章33條，主要規(guī)定了以下內(nèi)容：
一是明確生態(tài)保護補償?shù)膬?nèi)涵。生態(tài)保護補償是指通過財政縱向補償、地區(qū)間橫向補償、市場機制補償?shù)葯C制，對按照規(guī)定或者約定開展生態(tài)保護的單位和個人予以補償?shù)募钚灾贫劝才拧?/div>
二是明確工作原則、健全工作機制。生態(tài)保護補償工作堅持中國共產(chǎn)黨的領(lǐng)導，堅持政府主導、社會參與、市場調(diào)節(jié)相結(jié)合，堅持激勵與約束并重，堅持統(tǒng)籌協(xié)同推進，堅持生態(tài)效益與經(jīng)濟效益、社會效益相統(tǒng)一?？h級以上政府應當加強組織領(lǐng)導，國務院有關(guān)部門依據(jù)各自職責負責相關(guān)工作。
三是規(guī)范財政縱向補償。國家通過財政轉(zhuǎn)移支付等方式，對開展重要生態(tài)環(huán)境要素保護以及在生態(tài)功能重要區(qū)域開展生態(tài)保護的單位和個人予以補償。地方政府及其有關(guān)部門應當將補償資金及時補償給開展生態(tài)保護的單位和個人；由地方政府統(tǒng)籌使用的資金，應當優(yōu)先用于自然資源保護、生態(tài)環(huán)境治理和修復等。
四是完善地區(qū)間橫向補償。鼓勵、指導、推動生態(tài)受益地區(qū)與生態(tài)保護地區(qū)人民政府通過協(xié)商等方式建立生態(tài)保護補償機制。對在生態(tài)功能特別重要區(qū)域開展地區(qū)間橫向生態(tài)保護補償?shù)?，中央財政和省級財政可以給予引導支持；對補償機制建設取得顯著成效的，國務院發(fā)展改革、財政等部門可以在規(guī)劃、資金、項目安排等方面給予適當支持。
五是鼓勵推進市場機制補償。充分發(fā)揮市場機制作用，鼓勵社會力量以及地方政府按照市場規(guī)則，通過購買生態(tài)產(chǎn)品和服務等方式開展生態(tài)保護補償。鼓勵、引導社會資金建立市場化運作的生態(tài)保護補償基金，依法有序參與生態(tài)保護補償。
六是強化保障和監(jiān)督管理。政府及其有關(guān)部門應當及時下達和核撥生態(tài)保護補償資金，對截留、占用、挪用、拖欠或者未按照規(guī)定使用資金且逾期未改正的，可以緩撥、減撥、停撥或者追回資金。生態(tài)保護補償工作情況應當依法及時公開，資金管理使用情況由審計機關(guān)依法進行審計監(jiān)督。
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